Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc18a3O35304 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc18a3O35304 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc18a3O35304 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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