Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad6O35182 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad6O35182 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smad6O35182 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad6O35182 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad6O35182 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad6O35182 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad6O35182 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad6O35182 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad6O35182 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad6O35182 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad6O35182 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad6O35182 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad6O35182 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smad6O35182 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms