Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitx3O35160 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx3O35160 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms