Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casq1O09165 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casq1O09165 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casq1O09165 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casq1O09165 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casq1O09165 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casq1O09165 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casq1O09165 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casq1O09165 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms