Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LhbO09108 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LhbO09108 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LhbO09108 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LhbO09108 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LhbO09108 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LhbO09108 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LhbO09108 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LhbO09108 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LhbO09108 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LhbO09108 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LhbO09108 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LhbO09108 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LhbO09108 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LhbO09108 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LhbO09108 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LhbO09108 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LhbO09108 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LhbO09108 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LhbO09108 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LhbO09108 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LhbO09108 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LhbO09108 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LhbO09108 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LhbO09108 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LhbO09108 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LhbO09108 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LhbO09108 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LhbO09108 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LhbO09108 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LhbO09108 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LhbO09108 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LhbO09108 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LhbO09108 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LhbO09108 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LhbO09108 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LhbO09108 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LhbO09108 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LhbO09108 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LhbO09108 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LhbO09108 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LhbO09108 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LhbO09108 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LhbO09108 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LhbO09108 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LhbO09108 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LhbO09108 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LhbO09108 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LhbO09108 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LhbO09108 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LhbO09108 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LhbO09108 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LhbO09108 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LhbO09108 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LhbO09108 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LhbO09108 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LhbO09108 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LhbO09108 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LhbO09108 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LhbO09108 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LhbO09108 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LhbO09108 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LhbO09108 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LhbO09108 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LhbO09108 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LhbO09108 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LhbO09108 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LhbO09108 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LhbO09108 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LhbO09108 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LhbO09108 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LhbO09108 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LhbO09108 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LhbO09108 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LhbO09108 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LhbO09108 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LhbO09108 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LhbO09108 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LhbO09108 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LhbO09108 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LhbO09108 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LhbO09108 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LhbO09108 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LhbO09108 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LhbO09108 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LhbO09108 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LhbO09108 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LhbO09108 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LhbO09108 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LhbO09108 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LhbO09108 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LhbO09108 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LhbO09108 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LhbO09108 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LhbO09108 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LhbO09108 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LhbO09108 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LhbO09108 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LhbO09108 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LhbO09108 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms