Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube3aO08759 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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