Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfil3O08750 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfil3O08750 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfil3O08750 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms