Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MttpO08601 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MttpO08601 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MttpO08601 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MttpO08601 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MttpO08601 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MttpO08601 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MttpO08601 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MttpO08601 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MttpO08601 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MttpO08601 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MttpO08601 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MttpO08601 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MttpO08601 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MttpO08601 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MttpO08601 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
MttpO08601 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MttpO08601 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MttpO08601 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MttpO08601 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MttpO08601 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MttpO08601 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MttpO08601 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MttpO08601 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MttpO08601 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MttpO08601 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MttpO08601 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MttpO08601 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MttpO08601 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MttpO08601 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MttpO08601 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MttpO08601 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MttpO08601 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MttpO08601 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MttpO08601 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MttpO08601 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MttpO08601 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MttpO08601 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MttpO08601 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MttpO08601 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MttpO08601 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MttpO08601 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MttpO08601 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MttpO08601 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MttpO08601 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MttpO08601 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MttpO08601 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MttpO08601 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MttpO08601 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MttpO08601 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MttpO08601 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MttpO08601 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MttpO08601 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MttpO08601 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MttpO08601 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MttpO08601 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MttpO08601 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MttpO08601 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MttpO08601 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MttpO08601 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MttpO08601 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MttpO08601 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MttpO08601 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MttpO08601 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MttpO08601 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MttpO08601 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MttpO08601 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
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MttpO08601 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MttpO08601 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MttpO08601 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MttpO08601 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MttpO08601 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MttpO08601 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MttpO08601 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MttpO08601 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MttpO08601 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MttpO08601 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MttpO08601 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MttpO08601 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MttpO08601 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MttpO08601 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MttpO08601 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MttpO08601 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MttpO08601 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MttpO08601 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MttpO08601 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MttpO08601 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MttpO08601 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MttpO08601 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MttpO08601 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MttpO08601 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MttpO08601 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MttpO08601 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MttpO08601 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MttpO08601 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MttpO08601 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MttpO08601 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MttpO08601 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MttpO08601 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms