Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp35M0QWN7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Usp35M0QWN7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Usp35M0QWN7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Usp35M0QWN7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Usp35M0QWN7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Usp35M0QWN7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp35M0QWN7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp35M0QWN7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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