Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ascl4M0QW46 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ascl4M0QW46 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ascl4M0QW46 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ascl4M0QW46 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ascl4M0QW46 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ascl4M0QW46 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ascl4M0QW46 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ascl4M0QW46 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ascl4M0QW46 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ascl4M0QW46 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ascl4M0QW46 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ascl4M0QW46 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl4M0QW46 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms