Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU0

Spin2f, Spindlin family, member 2F, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2fJ3QPU0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spin2fJ3QPU0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spin2fJ3QPU0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms