Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5294J3QP53 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms