Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top6blJ3QMY9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Top6blJ3QMY9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms