Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tubgcp6G5E8P0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tubgcp6G5E8P0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tubgcp6G5E8P0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms