Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HrcG5E8J6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HrcG5E8J6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HrcG5E8J6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HrcG5E8J6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HrcG5E8J6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HrcG5E8J6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HrcG5E8J6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HrcG5E8J6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
HrcG5E8J6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HrcG5E8J6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HrcG5E8J6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
HrcG5E8J6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
HrcG5E8J6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HrcG5E8J6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms