Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sclt1G5E861 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sclt1G5E861 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms