Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r34G3XA52 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r34G3XA52 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r34G3XA52 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r34G3XA52 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r34G3XA52 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r34G3XA52 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r34G3XA52 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r34G3XA52 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r34G3XA52 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r34G3XA52 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r34G3XA52 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r34G3XA52 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r34G3XA52 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r34G3XA52 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r34G3XA52 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r34G3XA52 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r34G3XA52 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms