Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arfgef1G3X9K3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arfgef1G3X9K3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms