Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nccrp1G3X9C2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nccrp1G3X9C2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms