Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim15G3UY57 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms