Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34aG3UW52 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34aG3UW52 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms