Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ScaperF8VQ70 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ScaperF8VQ70 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ScaperF8VQ70 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
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