Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
BicraF8VPZ9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
BicraF8VPZ9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
BicraF8VPZ9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
BicraF8VPZ9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
BicraF8VPZ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
BicraF8VPZ9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
BicraF8VPZ9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
BicraF8VPZ9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
BicraF8VPZ9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
BicraF8VPZ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
BicraF8VPZ9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
BicraF8VPZ9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
BicraF8VPZ9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
BicraF8VPZ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.62
BicraF8VPZ9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
BicraF8VPZ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
BicraF8VPZ9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms