Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LctF8VPT3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LctF8VPT3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms