Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5160F8VPN3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5160F8VPN3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms