Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-M1F7CXU4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M1F7CXU4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms