Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3443F7CCV5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm3443F7CCV5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm3443F7CCV5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm3443F7CCV5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3443F7CCV5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3443F7CCV5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3443F7CCV5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3443F7CCV5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3443F7CCV5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3443F7CCV5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3443F7CCV5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3443F7CCV5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3443F7CCV5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3443F7CCV5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm3443F7CCV5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3443F7CCV5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm3443F7CCV5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3443F7CCV5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3443F7CCV5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3443F7CCV5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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