Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20538F6Z9R1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms