Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21970F6XX07 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21970F6XX07 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21970F6XX07 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms