Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10378F6XQQ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10378F6XQQ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10378F6XQQ1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10378F6XQQ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10378F6XQQ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10378F6XQQ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10378F6XQQ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10378F6XQQ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10378F6XQQ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm10378F6XQQ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Gm10378F6XQQ1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10378F6XQQ1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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