Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Crocc2F6XLV1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Crocc2F6XLV1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms