Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pagr1bF6V0H0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pagr1bF6V0H0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pagr1bF6V0H0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms