Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sptbn5F6UCX4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sptbn5F6UCX4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms