Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3072F6SKY8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms