Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28374F6SG70 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28374F6SG70 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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