Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cald1E9QA15 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cald1E9QA15 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cald1E9QA15 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms