Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5407E9Q7Q1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
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Gm5407E9Q7Q1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Gm5407E9Q7Q1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Gm5407E9Q7Q1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Gm5407E9Q7Q1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Gm5407E9Q7Q1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm5407E9Q7Q1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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Gm5407E9Q7Q1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms