Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf11E9Q6E5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms