Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb9E9Q5G2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb9E9Q5G2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms