Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn2r48E9Q5D8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms