Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DspE9Q557 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DspE9Q557 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DspE9Q557 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DspE9Q557 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DspE9Q557 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DspE9Q557 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DspE9Q557 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DspE9Q557 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DspE9Q557 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DspE9Q557 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DspE9Q557 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DspE9Q557 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DspE9Q557 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DspE9Q557 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DspE9Q557 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms