Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms