Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3020E9Q3J7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3020E9Q3J7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3020E9Q3J7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3020E9Q3J7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3020E9Q3J7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3020E9Q3J7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3020E9Q3J7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3020E9Q3J7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3020E9Q3J7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms