Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tarbp1E9Q368 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tarbp1E9Q368 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms