Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f2E9Q366 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4f2E9Q366 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms