Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd2E9Q1M1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd2E9Q1M1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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