Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt78E9Q0F0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt78E9Q0F0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms