Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3095E9Q058 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3095E9Q058 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms