Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm9972E9Q053 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms