Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd2E9PZM4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Chd2E9PZM4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Chd2E9PZM4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chd2E9PZM4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms